Jean-François GIOVANNELLI

Professor

Research group : SIGNAL AND IMAGE PROCESSING

Team : SPECTRAL

Tel : 0540003176

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Article (21)

Variance component analysis to assess protein quantification in biomarker discovery. Application to MALDI-TOF mass spectrometry Auteur(s): Catherine Mercier, Amna Klich, Caroline Truntzer, Vincent Picaud, Jean-François Giovannelli, Patrick Ducoroy, Pierre Grangeat, Delphine Maucort-Boulch, Pascal Roy Lien HAL : https://cea.hal.science/cea-01683000 A Statistical Framework to Investigate the Optimality of Signal-Reconstruction Methods Auteur(s): Pakshal Bohra, Pol del Aguila Pla, Jean-François Giovannelli, Michael Unser Lien HAL : https://hal.science/hal-04322442 An implementation of the NiftyRec medical imaging library for PIXE-tomography reconstruction Auteur(s): Claire Michelet, Philippe Barberet, Pascal Desbarats, Jean-François Giovannelli, C. Schou, I. Chebil, Marie-Hélène Delville, Nuria Gordillo, Daniel G. Beasley, Guillaume Devès, Philippe Moretto, Hervé Seznec Lien HAL : https://hal.science/hal-01544227 A kriging-based analysis of cloud liquid water content using CloudSat data Auteur(s): Jean-Marie Lalande, Guillaume Bourmaud, Pierre Minvielle, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-03763346 Unsupervised joint deconvolution and segmentation method for textured images: a Bayesian approach and an advanced sampling algorithm Auteur(s): Cornelia Vacar, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-02472301 Parametric Bayesian estimation of point-like pollution sources of groundwater layers Auteur(s): Boujemaa Ait-El-Fquih, Jean-François Giovannelli, Nicolas Paul, Alexandre Girard, Ibrahim Hoteit Lien HAL : https://hal.science/hal-02455068 Variance component analysis to assess protein quantification in biomarker validation: Application to SRM mass spectrometry Auteur(s): Amna Klich, Catherine Mercier, Laurent Gerfault, Pierre Grangeat, Corinne Beaulieu, Elodie Degout-Charmette, Tanguy Fortin, Pierre Mahé, Jean-François Giovannelli, Jean-Philippe Charrier, Audrey Giremus, Delphine Maucort Boulch, Pascal Roy Lien HAL : https://hal.science/hal-02531646 A Geant4 simulation for three-dimensional proton imaging of microscopic samples Auteur(s): Claire Michelet, Zhuxin Li, Wen Yang, Sébastien Incerti, Pascal Desbarats, Jean-François Giovannelli, Philippe Barberet, Marie-Hélène Delville, Nuria Gordillo, Guillaume Devès, Hervé Seznec Lien HAL : https://hal.science/hal-02281684 Indoor 3-D Radar Imaging for Low-RCS Analysis Auteur(s): Pierre Minvielle, Pierre Massaloux, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-01695128 Bayesian inference for biomarker discovery in proteomics: an analytic solution Auteur(s): Noura Dridi, Audrey Giremus, Jean-François Giovannelli, Caroline Truntzer, Melita Hadzagic, Jean-Philippe Charrier, Laurent Gerfault, Patrick Ducoroy, Bruno Lacroix, Pierre Grangeat, Pascal Roy Lien HAL : https://hal.science/hal-01695376 Bayesian Texture Classification From Indirect Observations Using Fast Sampling Auteur(s): Cornelia Vacar, Jean-François Giovannelli, Yannick Berthoumieu Lien HAL : https://hal.science/hal-01719190 Linear MALDI-ToF simultaneous spectrum deconvolution and baseline removal Auteur(s): Vincent Picaud, Jean-François Giovannelli, Caroline Truntzer, Jean-Philippe Charrier, Audrey Giremus, Pierre Grangeat, Catherine Mercier Lien HAL : https://cea.hal.science/cea-01917788 Classification of Proteomic MS Data as Bayesian Solution of an Inverse Problem Auteur(s): Pascal Szacherski, Jean-François Giovannelli, Laurent Gerfault, Pierre Mahé, Jean-Philippe Charrier, Audrey Giremus, Bruno Lacroix, Pierre Grangeat Lien HAL : https://cea.hal.science/cea-01615512 Bayesian Texture and Instrument Parameter Estimation From Blurred and Noisy Images Using MCMC Auteur(s): Cornelia Vacar, Jean-François Giovannelli, Yannick Berthoumieu Lien HAL : https://hal.science/hal-00975094 Estimating hyperparameters and instrument parameters in regularized inversion. Illustration for SPIRE/Herschel map making. Auteur(s): François Orieux, Jean-François Giovannelli, Thomas Rodet, Alain Abergel Lien HAL : https://hal.science/hal-00778082 Inverse transport for point-like source estimation with a Bayesian parametric method coupled with MCMC algorithm Auteur(s): Aurélien Hazart, Jean-François Giovannelli, Stéphanie Dubost, Laurence Chatellier Lien HAL : https://hal.science/hal-00879196 Sampling high-dimensional Gaussian distributions for general linear inverse problems Auteur(s): François F. Orieux, Olivier Féron, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-00779449 Super-resolution in map-making based on a physical instrument model and regularized inversion. Application to SPIRE/Herschel. Auteur(s): François Orieux, Jean-François Giovannelli, Thomas Rodet, Alain Abergel, H Ayasso, Mathieu Husson Lien HAL : https://hal.science/hal-00674514 Bayesian estimation of regularization and point spread function parameters for Wiener-Hunt deconvolution Auteur(s): François Orieux, Jean-François Giovannelli, Thomas Rodet Lien HAL : https://hal.science/hal-00674508 Data Inversion for Over-Resolved Spectral Imaging in Astronomy Auteur(s): Thomas Rodet, François Orieux, Jean-François Giovannelli, Alain Abergel Lien HAL : https://hal.science/hal-00411775 Image Reconstruction in Optical Interferometry Auteur(s): Eric Thiébaut, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-00416373

Conference proceedings (42)

Marginalized semi-blind restoration of Adaptive-Optics-corrected images using stochastic sampling Auteur(s): Alix Yan, Laurent Mugnier, Jean-François Giovannelli, Romain Fetick, Cyril Petit Lien HAL : https://hal.science/hal-04402866 Fast Bayesian Model Selection in Imaging Inverse Problems Using Residuals Auteur(s): Ana Fernandez Vidal, Marcelo Pereyra, Alain Durmus, Jean-Francois Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-04551521 Near-field microwave mapping by Bayesian inversion-segmentation Auteur(s): Julien Boissy, Jean-François Giovannelli, Pierre Minvielle Lien HAL : https://hal.science/hal-04354436 Convergence entre l’analyse biostatistique et les méthodes d’inversion hiérarchique bayésienne pour la recherche et la validation de biomarqueurs par spectrométrie de masse Auteur(s): Pierre Grangeat, Jean-François Giovannelli, Pascal Roy, Vincent Picaud, Caroline Truntzer, Jérôme Lemoine, Pierre Mahé, Jean-Philippe Charrier, Laurent Gerfault, Pascal Szacherski, Audrey Giremus, Noura Dridi, Amna Klich, Catherine Mercier, Delphine Maucort-Boulch, Olivier Gal, Patrick Ducoroy, Arnaud Salvador, Tanguy Fortin, Geneviève Choquet-Kastylevsky, Bruno Lacroix Lien HAL : https://cea.hal.science/cea-03996401 Restauration d'images de satellites corrigées par optique adaptative dans le visible Auteur(s): Alix Yan, Romain Fétick, Laurent M. Mugnier, Jean-François Giovannelli, Aurélie Bonnefois, Cyril Petit Lien HAL : https://hal.science/hal-03512158 Restauration d'images astronomiques corrigées par optique adaptative : méthode marginale étendue par algorithme MCMC Auteur(s): Alix Yan, Laurent Mugnier, Jean-François Giovannelli, Romain Fétick, Cyril Petit Lien HAL : https://hal.science/hal-03837136 Data inversion for hyperspectral objects in astronomy Auteur(s): Thomas Rodet, François Orieux, Jean-François Giovannelli, Alain Abergel Lien HAL : https://hal.science/hal-00416573 Deconvolution with gaussian blur parameter and hyperparameters estimation Auteur(s): François Orieux, Jean-François Giovannelli, Thomas Rodet Lien HAL : https://hal.science/hal-00546590 Cartographie d'impédance par inversion d'un code d'électromagnétisme 3D surfacique Auteur(s): Julien Boissy, Pierre Minvielle, Muriel Sesques, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-02456083 Instrument parameter estimation in bayesian convex deconvolution Auteur(s): François Orieux, Thomas Rodet, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-00546604 Segmentation bayésienne d'images constantes par morceaux: cas de distorsion non-linéaire, données manquantes et bruit de Poisson Auteur(s): Jean-François Giovannelli, Yoann Altmann Lien HAL : https://hal.science/hal-02446490 Sélection de modèles en restauration d'image : approche bayésienne dans le cas gaussien Auteur(s): Benjamin Harroué, Jean-François Giovannelli, Marcelo Pereyra Lien HAL : https://hal.science/hal-02493284 SPRITE : A New Sparse Approach for 3D High Resolution RCS Imaging Auteur(s): Thomas Benoudiba-Campanini, Pierre Minvielle, Jean-François Giovannelli, Pierre Massaloux Lien HAL : https://hal.science/hal-02506365 A Variational Bayesian Estimation Scheme For Parametric Point-Like Pollution Source of Groundwater Layers Auteur(s): Boujemaa Ait-El-Fquih, Jean-François Giovannelli, Nicolas Paul, Alexandre Girard, Ibrahim Hoteit Lien HAL : https://hal.science/hal-02455080 Super-resolution with continuous scan shift Auteur(s): François Orieux, Thomas Rodet, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-00416568 Indoor 3D spherical near field RCS measurement facility: Localization of scatterers Auteur(s): Pierre Minvielle, Pierre Massaloux, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-01722741 Bayesian noise model selection and system identification using Chib's approximation based on the Metropolis-Hastings sampler Auteur(s): Andrei-Cristian Bărbos, Audrey Giremus, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-01729077 Potts model parameter estimation in Bayesian segmentation of piecewise constant images Auteur(s): Roxana-Gabriela Rosu, Jean-François Giovannelli, Cornelia Vacar, Audrey Giremus Lien HAL : https://hal.science/hal-01695945 Régularisation parcimonieuse pour l’imagerie radar haute résolution 1D Auteur(s): Thomas Benoudiba-Campanini, Pierre Minvielle, Jean-François Giovannelli, Pierre Massaloux Lien HAL : https://hal.science/hal-01722231 A new regularization method for radar cross section imaging Auteur(s): Thomas Benoudiba-Campanini, Pierre Minvielle, Pierre Massaloux, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-01695368 A generalized Swendsen-Wang algorithm for Bayesian nonparametric joint segmentation of multiple images Auteur(s): Jessica Sodjo, Audrey Giremus, Nicolas Dobigeon, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-01695104 Expression explicite de l'évidence pour l'estimation du nombre de composantes d'un mélange de gaussiennes : cas particulier d'un petit nombre d'observations Auteur(s): Jessica Sodjo, Audrey Giremus, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-01722787 Clone MCMC: Parallel High-Dimensional Gaussian Gibbs Sampling Auteur(s): Andrei-Cristian Bărbos, Francois Caron, Jean-François Giovannelli, Arnaud Doucet Lien HAL : https://hal.science/hal-01713573 Joint segmentation of multiple images with shared classes: a Bayesian nonparametrics approach Auteur(s): Jessica Sodjo, Audrey Giremus, François Caron, Jean-François Giovannelli, Nicolas Dobigeon Lien HAL : https://hal.science/hal-01695100v2 Gradient scan Gibbs sampler: An efficient high-dimensional sampler application in inverse problems Auteur(s): François Orieux, O Féron, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-01225866 Automatisation non supervisée de la quantification par spectrométrie de masse Auteur(s): Laurent Gerfault, Jean-Philippe Charrier, Jean-François Giovannelli, Pierre Grangeat Lien HAL : https://cea.hal.science/cea-00991452 Sélection bayésienne de biomarqueurs : application à un problème de protéomique Auteur(s): Noura Dridi, Audrey Giremus, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-00879206 Variable selection for a mixed population applied in proteomics Auteur(s): Faouzi Adjed, Jean-François Giovannelli, Audrey Giremus, Noura Dridi, Pascal Szacherski Lien HAL : https://hal.science/hal-00879200 Robust protein quantification in mass spectrometry Auteur(s): Grégory Strubel, Caroline Paulus, E. Mery, Laurent Gerfault, F. Ricoul, Jean-François Giovannelli, Pierre Grangeat Lien HAL : https://hal.science/hal-00879204 MRM protein quantification and serum sample classification Auteur(s): Pascal Szacherski, Laurent Gerfault, Jean-François Giovannelli, Audrey Giremus, Pierre Mahé, Tanguy Fortin, Geneviève Choquet, Amna Klich, Catherine Mercier, Pascal Roy, Arnaud Salvador, Jérôme Lemoine, Jean-Philippe Charrier, Bruno Lacroix, Pierre Grangeat Lien HAL : https://hal.science/hal-00909875 BAYESIAN TEXTURE MODEL SELECTION BY HARMONIC MEAN Auteur(s): Cornelia Vacar, Jean-François Giovannelli, Ana-Maria Roman Lien HAL : https://hal.science/hal-00781487 Langevin and hessian with fisher approximation stochastic sampling for parameter estimation of structured covariance Auteur(s): Cornelia Vacar, Jean-François Giovannelli, Yannick Berthoumieu Lien HAL : https://hal.science/hal-00668308 Estimation bayésienne de sources de pollution de nappes phréatiques Auteur(s): Boujemaa Ait-El-Fqui, Jean-François Giovannelli, Alexandre Girard, Nicolas Paul Lien HAL : https://hal.science/hal-00669078 Estimation of the Ising field parameter from incomplete and noisy data Auteur(s): Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-00669079 Estimation of the Ising field parameter thanks to the exact partition function Auteur(s): Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-00669080 Robust MS serum sample classification in proteomics by the use of inverse problems Auteur(s): Pascal Szacherski, Jean-François Giovannelli, Laurent Gerfault, Audrey Giremus, Pierre Grangeat Lien HAL : https://hal.science/hal-00744709 Bayesian hierarchical reconstruction of protein profiles including a digestion model Auteur(s): Pierre Grangeat, Pascal Szacherski, Laurent Gerfault, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://hal.science/hal-00672814 Joint Bayesian Hierarchical Inversion-Classification and Application in Proteomics Auteur(s): Pascal Szacherski, Jean-François Giovannelli, Pierre Grangeat Lien HAL : https://hal.science/hal-00585529 Apprentissage supervisé robuste de caractéristiques de classes. Application en protéomique Auteur(s): Pascal Szacherski, Jean-François Giovannelli, Laurent Gerfault, Pierre Grangeat Lien HAL : https://hal.science/hal-00585531 Estimation du paramètre du champ de Ising et fonction de partition Auteur(s): Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://inria.hal.science/inria-00494801 Echantillonnage de champs gaussiens de grande dimension Auteur(s): Olivier Feron, François Orieux, Jean-François Giovannelli Lien HAL : https://inria.hal.science/inria-00494771 Evaluation statistique d'un algorithme bayésien pour la reconstruction de profils moléculaires par spectrométrie de masse Auteur(s): Laurent Gerfault, Grégory Strubel, Caroline Paulus, Jean-François Giovannelli, Pierre Grangeat Lien HAL : https://hal.science/hal-00416583

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