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Variance component analysis to assess protein quantification in biomarker validation: application to selected reaction monitoring-mass spectrometry Auteur(s): Amna Klich, Catherine Mercier, Laurent Gerfault, Pierre Grangeat, Corinne Beaulieu, Elodie Degout-Charmette, Tanguy Fortin, Pierre Mahé, Jean-François Giovannelli, Jean-Philippe Charrier, Audrey Giremus, Delphine Maucort Boulch, Pascal Roy Année de publication: 2025 Journal: BMC Bioinformatics DOI: 10.1186/s12859-018-2075-8 Lien HAL: https://hal.science/hal-02531646v1 X-ray simulations with gVXR in education, digital twining, experiment planning, and data analysis Auteur(s): Franck Vidal, Shaghayegh Afshari, Sharif Ahmed, Alberto Albiol, Francisco Albiol, Éric Béchet, Alberto Corbí Bellot, Stefan Bosse, Simon Burkhard, Younes Chahid, Cheng-Ying Chou, Robert Culver, Pascal Desbarats, Lewis Dixon, Johan Friemann, Amin Garbout, Marcos García-Lorenzo, Jean-François Giovannelli, Ross Hanna, Clémentine Hatton, Audrey Henry, Graham Kelly, Christophe Leblanc, Alberto Leonardi, Jean Michel Létang, Harry Lipscomb, Tristan Manchester, Bas Meere, Claire Michelet, Simon Middleburgh, Radu Mihail, Iwan Mitchell, Liam Perera, Martí Puig, Malek Racy, Ali Rouwane, Hervé Seznec, Aaron Sújar, Jenna Tugwell-Allsup, Pierre-Frédéric Villard Année de publication: 2025 Journal: Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms DOI: 10.1016/j.nimb.2025.165804 Lien HAL: https://hal.science/hal-05229346v1 Marginalized myopic deconvolution of Adaptive Optics corrected images using MCMC methods Auteur(s): Alix Yan, Laurent M. Mugnier, Jean-François Giovannelli, Romain Fétick, Cyril Petit Année de publication: 2024 Journal: Journal of Astronomical Telescopes, Instruments, and Systems DOI: 10.1117/1.JATIS.9.4.048004 Lien HAL: https://hal.science/hal-04051187v3 Variance component analysis to assess protein quantification in biomarker discovery. Application to MALDI-TOF mass spectrometry Auteur(s): Catherine Mercier, Amna Klich, Caroline Truntzer, Vincent Picaud, Jean-François Giovannelli, Patrick Ducoroy, Pierre Grangeat, Delphine Maucort-Boulch, Pascal Roy Année de publication: 2023 Journal: Biometrical Journal DOI: 10.1002/bimj.201600198 Lien HAL: https://cea.hal.science/cea-01683000v1 A Statistical Framework to Investigate the Optimality of Signal-Reconstruction Methods Auteur(s): Pakshal Bohra, Pol del Aguila Pla, Jean-François Giovannelli, Michael Unser Année de publication: 2023 Journal: IEEE Transactions on Signal Processing DOI: 10.1109/tsp.2023.3282062 Lien HAL: https://hal.science/hal-04322442v1 An implementation of the NiftyRec medical imaging library for PIXE-tomography reconstruction Auteur(s): Claire Michelet, Philippe Barberet, Pascal Desbarats, Jean-François Giovannelli, C. Schou, I. Chebil, Marie-Hélène Delville, Nuria Gordillo, Daniel G. Beasley, Guillaume Devès, Philippe Moretto, Hervé Seznec Année de publication: 2023 Journal: Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms DOI: 10.1016/j.nimb.2017.01.067 Lien HAL: https://hal.science/hal-01544227v1 A kriging-based analysis of cloud liquid water content using CloudSat data Auteur(s): Jean-Marie Lalande, Guillaume Bourmaud, Pierre Minvielle, Jean-François Giovannelli Année de publication: 2022 Journal: Atmospheric Measurement Techniques DOI: 10.5194/amt-15-4411-2022 Lien HAL: https://hal.science/hal-03763346v1Conference proceedings (12)
A Probabilistic Model for Image Processing with Positivity Constraint and Spectral Density Control Auteur(s): Pierre Minier, Jean-François Giovannelli, François Orieux Année de publication: 2025 Journal: DOI: Lien HAL: https://hal.science/hal-05049694v1 X-ray simulations with gVirtualXray in medicine and life sciences Auteur(s): Franck Vidal, Shaghayegh Afshari, Alberto Albiol, Alberto Corbi Bellot, Anna Louise Brun, Chengy-Ying Chou, Pascal Desbarats, Marcos García, Jean-Francois Giovannelli, Clémentine Hatton, Audrey Henry, Graham Kelly, Claire Michelet, Radu P. Mihail, Malek Racy, Ali Rouwane, Herve Seznec, Jenna Tugwell-Allsup, Pierre-Frédéric Villard Année de publication: 2025 Journal: DOI: 10.2312/evm.20251974 Lien HAL: https://hal.univ-lorraine.fr/hal-05129468v1 Evaluating the Posterior Sampling Ability of Plug&Play Diffusion Methods in Sparse-View CT Auteur(s): Liam Moroy, Guillaume Bourmaud, Jean-François Giovannelli, Frédéric Champagnat Année de publication: 2025 Journal: DOI: 10.1109/ICASSP49660.2025.10888207 Lien HAL: https://hal.science/hal-05119325v1 Restauration d'images corrigées par optique adaptative : approche marginale avec échantillonnage bayésien Auteur(s): Alix Yan, Laurent M. Mugnier, Jean-François Giovannelli, Romain Fétick, Cyril Petit Année de publication: 2025 Journal: DOI: Lien HAL: https://hal.science/hal-04903186v1 Marginalized semi-blind restoration of Adaptive-Optics-corrected images using stochastic sampling Auteur(s): Alix Yan, Laurent Mugnier, Jean-François Giovannelli, Romain Fetick, Cyril Petit Année de publication: 2024 Journal: DOI: 10.13009/AO4ELT7-2023-119 Lien HAL: https://hal.science/hal-04402866v1 Restauration myope marginale d'images corrigées par optique adaptative avec échantillonnage stochastique Auteur(s): Alix Yan, Laurent M. Mugnier, Jean-François Giovannelli, Romain Fétick, Cyril Petit Année de publication: 2024 Journal: DOI: Lien HAL: https://hal.science/hal-04769298v1 Extending AMIRAL’s blind deconvolution of Adaptive Optics corrected images with Markov chain Monte Carlo methods Auteur(s): Alix Yan, Laurent Mugnier, Jean-François Giovannelli, Romain Fétick, Cyril Petit Année de publication: 2024 Journal: DOI: 10.1117/12.2627414 Lien HAL: https://hal.science/hal-04765078v1 Fast Bayesian Model Selection in Imaging Inverse Problems Using Residuals Auteur(s): Ana Fernandez Vidal, Marcelo Pereyra, Alain Durmus, Jean-Francois Giovannelli Année de publication: 2024 Journal: DOI: 10.1109/SSP49050.2021.9513766 Lien HAL: https://hal.science/hal-04551521v1 Near-field microwave mapping by Bayesian inversion-segmentation Auteur(s): Julien Boissy, Jean-François Giovannelli, Pierre Minvielle Année de publication: 2023 Journal: DOI: Lien HAL: https://hal.science/hal-04354436v1 Convergence entre l’analyse biostatistique et les méthodes d’inversion hiérarchique bayésienne pour la recherche et la validation de biomarqueurs par spectrométrie de masse Auteur(s): Pierre Grangeat, Jean-François Giovannelli, Pascal Roy, Vincent Picaud, Caroline Truntzer, Jérôme Lemoine, Pierre Mahé, Jean-Philippe Charrier, Laurent Gerfault, Pascal Szacherski, Audrey Giremus, Noura Dridi, Amna Klich, Catherine Mercier, Delphine Maucort-Boulch, Olivier Gal, Patrick Ducoroy, Arnaud Salvador, Tanguy Fortin, Geneviève Choquet-Kastylevsky, Bruno Lacroix Année de publication: 2023 Journal: DOI: Lien HAL: https://cea.hal.science/cea-03996401v1 Restauration d'images astronomiques corrigées par optique adaptative : méthode marginale étendue par algorithme MCMC Auteur(s): Alix Yan, Laurent Mugnier, Jean-François Giovannelli, Romain Fétick, Cyril Petit Année de publication: 2022 Journal: DOI: Lien HAL: https://hal.science/hal-03837136v1 Restauration d'images de satellites corrigées par optique adaptative dans le visible Auteur(s): Alix Yan, Romain Fétick, Laurent M. Mugnier, Jean-François Giovannelli, Aurélie Bonnefois, Cyril Petit Année de publication: 2022 Journal: DOI: Lien HAL: https://hal.science/hal-03512158v1Send a email to Jean-François GIOVANNELLI :
